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体外转录

T7高效体外转录试剂盒

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产品概述

本产品是一款基于T7 RNA聚合酶的RNA体外转录试剂盒,其可以含有T7启动子序列的线性双链DNA为模板,以NTPs为底物,从T7启动子下游开始合成与模板DNA中一条链互补的RNA,短时间内即可获得大量的RNA分子。此外,转录时也可在底物中添加修饰后的核苷酸,制备生物素或染料标记的RNA。

本试剂盒可兼容长转录本和短转录本的合成,添加0.5μg DNA模板,即可收获100-200μg RNA,其转录合成的RNA可用于体外翻译、反义RNA和RNAi以及RNA剪接等相关研究。

产品内容
T7 RNA Polymerase Premix100μL
10 × Reaction Buffer100μL
DNase Ⅰ(RNase-free, 2 U/μL)50μL
ATP(Tris buffered, 75 mM)100μL
GTP(Tris buffered, 75 mM)100μL
CTP(Tris buffered, 75 mM)100μL
UTP(Tris buffered, 75 mM)100μL
Control Template(0.5 μg/μL)10μL
RNase-free ddH2O5mL
Lithium Chloride Solution(6 mol/L)1mL

操作步骤

  • fen101.png

  • 一、模版制备
    带有双链T7启动子的PCR产物、线性化质粒以及合成的DNA片段均可作为本产品的体外转录模板,模板可用TE缓冲液或RNase-free ddH2O进行溶解(推荐浓度为0.5μg/uL)。

  • PCR产物模板(每个反应推荐用量为0.3~0.5μg)
    PCR扩增模板DNA时,将T7启动子序列(TAATACGACTCACTATAGGG)预先加在非编码链上游引物的5'端,即可扩增得到带有T7启动子的PCR产物,经电泳确认其单一性后,即可作为体外转录模板。

  • 线性化质粒模板(每个反应推荐用量为1μg)
    带T7启动子的线性化质粒可作为体外转录模板,需确保其双链为平末端或编码链5'端为突出结构,且质粒的线性化程度和纯度会影响转录的产量及RNA的完整性。
    注意:质粒线性化后,需经过纯化方可作为体外转录模板,以避免RNase、RNA、蛋白及盐残留对反应体系的干扰。

  • 合成的DNA模板(每个反应推荐用量为0.3~0.5μg)
    合成的带有T7启动子的DNA片段也可以作为体外转录的模板。

  • 二、体外转录
    进行体外转录实验操作,需佩戴一次性手套和口罩,并使用无核酸酶耗材和试剂,以避免引入RNase污染。
    1. 将除T7 RNA Polymerase Premix外的其它组分振荡混匀,短暂离心收集于管底,置于冰上备用;
    2. 按下表配制反应体系(根据DNA模板的长度确定其用量,推荐用量为0.3~1    μg):

  • fen1011.png

  • fen1012.png

  • *体系以Modified UTP为例,若使用其它Modified NTP底物,可参照UTP Solution与Modified UTP比例配制反应体系。

  • 3. 用移液器轻柔混匀各组分,并短暂离心收集于管底,37℃孵育2h;
        注意:① 建议在PCR仪中进行反应,将热盖打开,以避免蒸发对反应体系造成影响;
                  ②可根据产物片段大小调整反应时长,如RNA产物小于300bp,可延长反应至4h或更长时间,16h过夜反应对产物质量无影响。

    4. (可选)在反应体系中加入1μL DNaseⅠ,37℃孵育15min,去除DNA模板;
        注意:相对于产物RNA,模板DNA的含量非常低,一般不用去除。

    5. RNA产物经电泳分析及纯化后,即可用于下游实验。
        注意:产物浓度极高,需用RNase-free ddH2O稀释后再检测。

  • 三、RNA纯化
    1. 向转录体系中加入等体积的Lithium Chloride Solution,混匀,12,000×g 离心2min,小心吸弃上清;
    2. 向离心管中加入200μL 75%乙醇,12,000×g离心2min,小心吸弃上清;
    3. 重复上一步操作;
    4. 吸弃上清后,将离心管开盖室温置于通风处5min,以确保彻底去除残留的乙醇;
    5. 加入 30~50 uL 的 RNase-free ddH2O 溶解 RNA。
        注意:产物 RNA 纯化也可根据情况选择酚 / 氯仿纯化法或柱纯化法。

  • 四、RNA定量
    可选择以下方法进行RNA定量:
    紫外吸收法:游离核苷酸会影响定量的准确性,定量前请先对RNA产物进行纯化;
    染料法:用RiboGreen染料进行RNA定量,游离核苷酸不会影响定量,可以对纯化或未纯化的RNA产物进行准确定量。

  • 五、结果验证
    在标准体外转录反应体系中分别加入0.5kb、1.0kb、2.0kb以及3.0kb的DNA模板各0.5μg,37℃孵育2h,反应结束加入1μL DNase Ⅰ,37℃孵育15min。最后进行RNA产物纯化,并通过核酸凝胶电泳进行检测,结果如下。

  • fen1013.png

  • 在标准体外转录反应体系中分别加入2.0kb和3.0kb的DNA模板各0.5μg,每隔20min对RNA转录产率进行统计,对于长片段DNA模板的体外转录,通常反应2h即可得到100μg以上的RNA。

  • fen1014.png

注意事项

1. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作;

2. 本产品仅限科研使用。

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